| 1. Journée | 05.08.2006 | Birmingham City | - | Colchester United | 2:1 | ||||
| 5. Journée | 26.08.2006 | Colchester United | - | Derby County | 4:3 | ||||
| 6. Journée | 09.09.2006 | Burnley FC | - | Colchester United | 1:2 | ||||
| 9. Journée | 23.09.2006 | Leicester City | - | Colchester United | 0:0 | ||||
| 12. Journée | 18.10.2006 | Colchester United | - | Sheffield Wednesday | 4:0 | ||||
| 17. Journée | 11.11.2006 | Leeds United | - | Colchester United | 3:0 | ||||
| 29. Journée | 20.01.2007 | Ipswich Town | - | Colchester United | 3:2 | ||||
| 30. Journée | 30.01.2007 | Colchester United | - | Preston North End | 1:0 | ||||
| 31. Journée | 03.02.2007 | Colchester United | - | Birmingham City | 1:1 | ||||
| 32. Journée | 10.02.2007 | Barnsley FC | - | Colchester United | 0:3 | ||||
| 33. Journée | 13.02.2007 | Colchester United | - | West Bromwich Albion | 1:2 | ||||
| 34. Journée | 20.02.2007 | Plymouth Argyle | - | Colchester United | 3:0 | ||||
| 36. Journée | 02.03.2007 | Derby County | - | Colchester United | 5:1 | ||||
| 39. Journée | 16.03.2007 | Southampton FC | - | Colchester United | 1:2 | ||||
| 41. Journée | 06.04.2007 | Southend United | - | Colchester United | 0:3 | ||||
| 46. Journée | 06.05.2007 | Colchester United | - | Crystal Palace | 0:2 |
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