| 4. Journée | 16.08.2015 | FC St. Pauli II | - | VfB Oldenburg | 2:3 |  |
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| 5. Journée | 23.08.2015 | Lüneburger SK Hansa | - | FC St. Pauli II | 3:3 |  |
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| 6. Journée | 29.08.2015 | FC St. Pauli II | - | Goslarer SC | 3:2 | ||||
| 7. Journée | 06.09.2015 | TSV Schilksee | - | FC St. Pauli II | 1:2 | ||||
| 10. Journée | 27.09.2015 | FC St. Pauli II | - | ETSV Weiche Flensburg | 1:2 | |
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| 16. Journée | 06.11.2015 | FC St. Pauli II | - | Hannover 96 II | 2:1 | ||||
| 19. Journée | 28.11.2015 | Schwarz-Weiß Rehden | - | FC St. Pauli II | 3:1 | |
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| 17. Journée | 02.12.2015 | TSV Havelse | - | FC St. Pauli II | 0:2 | |
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| 20. Journée | 06.12.2015 | FC St. Pauli II | - | VfB Lübeck | 1:2 | ||||
| 30. Journée | 14.12.2015 | Hamburger SV II | - | FC St. Pauli II | 1:1 | ||||
| 18. Journée | 30.01.2016 | FC St. Pauli II | - | VfV Hildesheim | 2:2 | |
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| 25. Journée | 12.03.2016 | VfL Wolfsburg II | - | FC St. Pauli II | 3:1 | |
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| 29. Journée | 17.04.2016 | Eintracht Norderstedt | - | FC St. Pauli II | 0:4 | |
|
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| 13. Journée | 22.04.2016 | FC St. Pauli II | - | Hamburger SV II | 2:1 | ||||
| 31. Journée | 30.04.2016 | SV Meppen | - | FC St. Pauli II | 5:0 | |
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| 34. Journée | 21.05.2016 | FC St. Pauli II | - | TSV Havelse | 3:1 | |
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