| 11. Journée | 28.10.2012 | 1. FC Union Berlin | - | SC Paderborn 07 | 0:1 | ||||
| 12. Journée | 02.11.2012 | Jahn Regensburg | - | SC Paderborn 07 | 0:2 | ||||
| 13. Journée | 10.11.2012 | SC Paderborn 07 | - | 1. FC Kaiserslautern | 1:1 | ||||
| 14. Journée | 17.11.2012 | VfR Aalen | - | SC Paderborn 07 | 0:1 |  |
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| 16. Journée | 27.11.2012 | TSV 1860 München | - | SC Paderborn 07 | 1:0 | ||||
| 19. Journée | 16.12.2012 | VfL Bochum | - | SC Paderborn 07 | 4:0 | ||||
| 21. Journée | 10.02.2013 | FC Ingolstadt 04 | - | SC Paderborn 07 | 1:3 | ||||
| 23. Journée | 24.02.2013 | SV Sandhausen | - | SC Paderborn 07 | 1:3 |
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