| 3. Journée | 20.09.1998 | Valencia CF | - | Villarreal CF | 1:0 |  |
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| 11. Journée | 22.11.1998 | Deportivo La Coruña | - | Villarreal CF | 2:1 | ||||
| 13. Journée | 06.12.1998 | Villarreal CF | - | Real Valladolid | 2:1 | ||||
| 18. Journée | 17.01.1999 | Racing Santander | - | Villarreal CF | 1:2 | ||||
| 19. Journée | 24.01.1999 | Villarreal CF | - | CF Extremadura | 1:1 | ||||
| 20. Journée | 30.01.1999 | Villarreal CF | - | Real Madrid | 0:2 | ||||
| 21. Journée | 07.02.1999 | RC Celta | - | Villarreal CF | 4:1 | |
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| 28. Journée | 04.04.1999 | Villarreal CF | - | RCD Mallorca | 0:2 | ||||
| 33. Journée | 09.05.1999 | Villarreal CF | - | FC Barcelona | 2:3 | ||||
| 34. Journée | 16.05.1999 | Athletic Club | - | Villarreal CF | 2:0 | ||||
| 36. Journée | 30.05.1999 | Real Zaragoza | - | Villarreal CF | 4:0 |
Espagne