| 1. Journée | 28.07.2019 | VfB Oldenburg | - | FC St. Pauli II | 1:0 | ||||
| 3. Journée | 04.08.2019 | Werder Bremen II | - | FC St. Pauli II | 2:2 | ||||
| 4. Journée | 11.08.2019 | FC St. Pauli II | - | Eintracht Norderstedt | 4:2 | ||||
| 5. Journée | 17.08.2019 | VfB Lübeck | - | FC St. Pauli II | 3:2 | ||||
| 6. Journée | 24.08.2019 | FC St. Pauli II | - | Hannover 96 II | 1:2 |  |
|||
| 7. Journée | 28.08.2019 | SV Drochtersen/Assel | - | FC St. Pauli II | 3:3 | ||||
| 8. Journée | 01.09.2019 | FC St. Pauli II | - | SSV Jeddeloh II | 0:0 | ||||
| 9. Journée | 08.09.2019 | Altona 93 | - | FC St. Pauli II | 2:1 | ||||
| 11. Journée | 21.09.2019 | Heider SV | - | FC St. Pauli II | 2:0 | ||||
| 14. Journée | 12.10.2019 | VfL Wolfsburg II | - | FC St. Pauli II | 5:1 | ||||
| 20. Journée | 24.11.2019 | FC St. Pauli II | - | Werder Bremen II | 1:1 | ||||
| 21. Journée | 01.12.2019 | Eintracht Norderstedt | - | FC St. Pauli II | 0:0 |  |
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| 19. Journée | 14.12.2019 | Hamburger SV II | - | FC St. Pauli II | 1:1 | ||||
| 24. Journée | 01.03.2020 | FC St. Pauli II | - | SV Drochtersen/Assel | 3:0 | |
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| 25. Journée | 07.03.2020 | SSV Jeddeloh II | - | FC St. Pauli II | 0:0 |
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