| 5. Journée | 19.08.2019 | Hallescher FC | - | Bayern München II | 1:2 | ||||
| 21. Journée | 26.01.2020 | KFC Uerdingen 05 | - | Bayern München II | 0:3 | ||||
| 23. Journée | 08.02.2020 | Viktoria Köln | - | Bayern München II | 2:4 | ||||
| 24. Journée | 17.02.2020 | Bayern München II | - | Hallescher FC | 6:1 | ||||
| 25. Journée | 24.02.2020 | Chemnitzer FC | - | Bayern München II | 1:0 | ||||
| 26. Journée | 28.02.2020 | SpVgg Unterhaching | - | Bayern München II | 0:1 |  |
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| 27. Journée | 07.03.2020 | Bayern München II | - | SG Sonnenhof Großaspach | 2:0 | |
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| 28. Journée | 30.05.2020 | FC Ingolstadt 04 | - | Bayern München II | 1:2 |  |
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| 29. Journée | 03.06.2020 | Bayern München II | - | Preußen Münster | 3:2 | ||||
| 30. Journée | 06.06.2020 | Eintracht Braunschweig | - | Bayern München II | 1:1 | |
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| 37. Journée | 01.07.2020 | Bayern München II | - | MSV Duisburg | 2:2 | ||||
| 38. Journée | 04.07.2020 | 1. FC Kaiserslautern | - | Bayern München II | 1:0 | |
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