| 1. Journée | 25.07.2015 | FC St. Pauli | - | Arminia Bielefeld | 0:0 |  |
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| 2. Journée | 02.08.2015 | Karlsruher SC | - | FC St. Pauli | 1:2 | ||||
| 8. Journée | 23.09.2015 | FC St. Pauli | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 1:0 | |
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| 9. Journée | 26.09.2015 | SC Paderborn 07 | - | FC St. Pauli | 0:0 | ||||
| 10. Journée | 03.10.2015 | FC St. Pauli | - | SV Sandhausen | 1:3 | ||||
| 11. Journée | 17.10.2015 | 1. FC Union Berlin | - | FC St. Pauli | 3:3 | ||||
| 12. Journée | 25.10.2015 | FC St. Pauli | - | SC Freiburg | 1:0 | ||||
| 13. Journée | 30.10.2015 | VfL Bochum | - | FC St. Pauli | 1:1 |  |
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| 14. Journée | 09.11.2015 | FC St. Pauli | - | Fortuna Düsseldorf | 4:0 | ||||
| 16. Journée | 29.11.2015 | FC St. Pauli | - | 1. FC Nürnberg | 0:4 | ||||
| 17. Journée | 06.12.2015 | 1. FC Kaiserslautern | - | FC St. Pauli | 1:2 | ||||
| 18. Journée | 14.12.2015 | Arminia Bielefeld | - | FC St. Pauli | 0:0 | |
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| 27. Journée | 19.03.2016 | SV Sandhausen | - | FC St. Pauli | 0:2 | |
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| 29. Journée | 10.04.2016 | SC Freiburg | - | FC St. Pauli | 4:3 | |
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| 34. Journée | 15.05.2016 | FC St. Pauli | - | 1. FC Kaiserslautern | 5:2 | |
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