| 2. Journée | 03.08.2005 | FC Carl Zeiss Jena | - | Bayer Leverkusen II | 1:1 | ||||
| 23. Journée | 10.02.2006 | Bayer Leverkusen II | - | VfL Osnabrück | 1:0 | ||||
| 25. Journée | 22.02.2006 | Bayer Leverkusen II | - | Rot-Weiss Essen | 1:1 | ||||
| 22. Journée | 01.03.2006 | Holstein Kiel | - | Bayer Leverkusen II | 2:0 | ||||
| 27. Journée | 11.03.2006 | Bayer Leverkusen II | - | FC St. Pauli | 2:1 | ||||
| 29. Journée | 26.03.2006 | Bayer Leverkusen II | - | Werder Bremen II | 2:1 | ||||
| 26. Journée | 29.03.2006 | 1. FC Köln II | - | Bayer Leverkusen II | 5:0 | ||||
| 30. Journée | 01.04.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | Bayer Leverkusen II | 3:1 |  |
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| 31. Journée | 08.04.2006 | Bayer Leverkusen II | - | Kickers Emden | 1:0 |  |
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| 28. Journée | 11.04.2006 | Hamburger SV II | - | Bayer Leverkusen II | 2:0 | ||||
| 33. Journée | 22.04.2006 | Bayer Leverkusen II | - | Fortuna Düsseldorf | 2:3 | ||||
| 34. Journée | 29.04.2006 | Rot-Weiß Oberhausen | - | Bayer Leverkusen II | 0:4 | ||||
| 35. Journée | 07.05.2006 | Bayer Leverkusen II | - | Wuppertaler SV | 2:1 | ||||
| 37. Journée | 20.05.2006 | Hertha BSC II | - | Bayer Leverkusen II | 0:3 |
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