| 1er tour | 18.09.2008 | Dinamo Zagreb | - | AC Sparta Praha | 0:0 | ||||
| 1er tour | 02.10.2008 | AC Sparta Praha | - | Dinamo Zagreb | 3:3 |  |
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| Groupe D | 23.10.2008 | Dinamo Zagreb | - | NEC Nijmegen | 3:2 |  |
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| Groupe D | 06.11.2008 | Tottenham Hotspur | - | Dinamo Zagreb | 4:0 | ||||
| Groupe D | 27.11.2008 | Dinamo Zagreb | - | Spartak Moskva | 0:1 | |
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| Groupe D | 03.12.2008 | Udinese Calcio | - | Dinamo Zagreb | 2:1 | |
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