| 17. Journée | 19.02.2000 | NK Istra Pula | - | NK Varteks | 0:2 | ||||
| 18. Journée | 26.02.2000 | NK Varteks | - | NK Vukovar 91 | 2:0 |  |
|||
| 19. Journée | 29.02.2000 | NK Zagreb | - | NK Varteks | 1:0 | ||||
| 20. Journée | 04.03.2000 | NK Varteks | - | Slaven Belupo | 0:1 | ||||
| 21. Journée | 07.03.2000 | NK Osijek | - | NK Varteks | 1:1 | ||||
| 22. Journée | 11.03.2000 | NK Varteks | - | Hrvatski Dragovoljac | 0:0 | ||||
| 23. Journée | 18.03.2000 | Croatia Zagreb | - | NK Varteks | 0:1 | ||||
| 24. Journée | 25.03.2000 | HNK Cibalia | - | NK Varteks | 2:0 | ||||
| 25. Journée | 01.04.2000 | NK Varteks | - | Slaven Belupo | 0:0 | ||||
| 26. Journée | 08.04.2000 | NK Zagreb | - | NK Varteks | 1:2 |  |
|||
| 27. Journée | 11.04.2000 | NK Varteks | - | Hrvatski Dragovoljac | 1:1 | ||||
| 28. Journée | 15.04.2000 | HNK Rijeka | - | NK Varteks | 4:0 | ||||
| 29. Journée | 24.04.2000 | NK Varteks | - | NK Vukovar 91 | 3:2 | |
|||
| 30. Journée | 29.04.2000 | NK Osijek | - | NK Varteks | 0:0 | ||||
| 31. Journée | 06.05.2000 | NK Varteks | - | NK Istra Pula | 1:2 | ||||
| 32. Journée | 09.05.2000 | Hajduk Split | - | NK Varteks | 0:0 | ||||
| 33. Journée | 13.05.2000 | NK Varteks | - | HNK Šibenik | 1:1 |
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