| 24. Journée | 28.03.2006 | SC Pfullendorf | - | SV 07 Elversberg | 3:1 |  |
|||
| 26. Journée | 31.03.2006 | SC Pfullendorf | - | FC Augsburg | 2:2 | ||||
| 21. Journée | 05.04.2006 | Bayern München II | - | SC Pfullendorf | 0:0 | ||||
| 27. Journée | 08.04.2006 | SpVgg Bayreuth | - | SC Pfullendorf | 2:0 | ||||
| 28. Journée | 15.04.2006 | SC Pfullendorf | - | 1. FC Eschborn | 2:0 | |
|||
| 20. Journée | 18.04.2006 | SC Pfullendorf | - | SV Darmstadt 98 | 3:1 | ||||
| 29. Journée | 22.04.2006 | TSV 1860 München II | - | SC Pfullendorf | 0:1 | ||||
| 30. Journée | 28.04.2006 | SC Pfullendorf | - | VfB Stuttgart II | 0:0 | ||||
| 22. Journée | 02.05.2006 | SC Pfullendorf | - | Stuttgarter Kickers | 0:2 | ||||
| 31. Journée | 06.05.2006 | Karlsruher SC II | - | SC Pfullendorf | 0:4 | |
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| 23. Journée | 09.05.2006 | TSG Hoffenheim | - | SC Pfullendorf | 1:0 | ||||
| 32. Journée | 13.05.2006 | SC Pfullendorf | - | 1. FC Kaiserslautern II | 2:0 | ||||
| 33. Journée | 20.05.2006 | Eintracht Trier | - | SC Pfullendorf | 2:1 | |
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| 34. Journée | 27.05.2006 | SC Pfullendorf | - | Jahn Regensburg | 0:0 |
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