| 21. Journée | 24.02.2001 | Wacker Burghausen | - | Sportfreunde Siegen | 0:0 |  |
|||
| 22. Journée | 03.03.2001 | TSV 1860 München II | - | Wacker Burghausen | 1:1 | ||||
| 25. Journée | 30.03.2001 | Wacker Burghausen | - | SV Darmstadt 98 | 2:1 | ||||
| 26. Journée | 07.04.2001 | Wacker Burghausen | - | SC Pfullendorf | 1:2 | ||||
| 27. Journée | 12.04.2001 | Jahn Regensburg | - | Wacker Burghausen | 1:1 | ||||
| 28. Journée | 21.04.2001 | Wacker Burghausen | - | Eintracht Trier | 0:1 | ||||
| 29. Journée | 28.04.2001 | Rot-Weiß Erfurt | - | Wacker Burghausen | 0:1 | ||||
| 31. Journée | 12.05.2001 | VfR Mannheim | - | Wacker Burghausen | 1:1 | ||||
| 32. Journée | 18.05.2001 | Wacker Burghausen | - | VfB Stuttgart II | 1:1 | ||||
| 33. Journée | 23.05.2001 | Kickers Offenbach | - | Wacker Burghausen | 0:0 | ||||
| 34. Journée | 26.05.2001 | Wacker Burghausen | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 1:1 |
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