| 31. Journée | 20.11.2011 | FK Rostov | - | FK Tom Tomsk | 3:1 | ||||
| 33. Journée | 03.03.2012 | Terek Grozny | - | FK Tom Tomsk | 1:0 | ||||
| 35. Journée | 18.03.2012 | FK Amkar Perm | - | FK Tom Tomsk | 0:0 | ||||
| 37. Journée | 30.03.2012 | Spartak Nalchik | - | FK Tom Tomsk | 0:2 | ||||
| 38. Journée | 08.04.2012 | FK Krasnodar | - | FK Tom Tomsk | 3:1 | ||||
| 39. Journée | 14.04.2012 | FK Tom Tomsk | - | Terek Grozny | 3:0 |  |
|||
| 40. Journée | 21.04.2012 | Volga Nizhniy Novgorod | - | FK Tom Tomsk | 2:0 |  |
|||
| 42. Journée | 03.05.2012 | Krylia Sovetov | - | FK Tom Tomsk | 1:0 | ||||
| 43. Journée | 07.05.2012 | FK Tom Tomsk | - | Spartak Nalchik | 1:1 | ||||
| 44. Journée | 13.05.2012 | FK Tom Tomsk | - | FK Rostov | 2:1 | |
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