| Super League | 14.01.07 | Iraklis Saloniki | - | PAOK Saloniki | 1:0 | ||||
| Ethniki B | 05.01.19 | Chania Kissamikos | - | AEP Iraklis FC | 0:1 |  |
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| Ethniki B | 06.04.19 | AEP Iraklis FC | - | Chania Kissamikos | 0:0 | ||||
| SL2 | 22.12.22 | AEP Iraklis FC | - | Apollon Pontou | 2:0 | ||||
| SL2 | 02.05.23 | Apollon Pontou | - | AEP Iraklis FC | 0:5 | ||||
| SL2 | 15.11.23 | AEP Iraklis FC | - | Apollon Pontou | 0:1 | ||||
| SL2 | 14.02.24 | Apollon Pontou | - | AEP Iraklis FC | 0:1 |
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