| 21. Journée | 06.03.2004 | FC St. Pauli | - | Wuppertaler SV | 1:2 | ||||
| 22. Journée | 13.03.2004 | Wuppertaler SV | - | Dynamo Dresden | 1:1 | ||||
| 23. Journée | 21.03.2004 | Preußen Münster | - | Wuppertaler SV | 1:1 |  |
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| 20. Journée | 30.03.2004 | Wuppertaler SV | - | SG Wattenscheid 09 | 0:1 |  |
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| 25. Journée | 03.04.2004 | Wuppertaler SV | - | Holstein Kiel | 2:1 | ||||
| 24. Journée | 06.04.2004 | Hamburger SV II | - | Wuppertaler SV | 0:1 | ||||
| 26. Journée | 10.04.2004 | Rot-Weiss Essen | - | Wuppertaler SV | 5:2 | ||||
| 27. Journée | 17.04.2004 | Wuppertaler SV | - | Chemnitzer FC | 1:2 | ||||
| 28. Journée | 24.04.2004 | SC Paderborn 07 | - | Wuppertaler SV | 0:0 | ||||
| 29. Journée | 01.05.2004 | Wuppertaler SV | - | FC Schalke 04 II | 1:1 | ||||
| 31. Journée | 15.05.2004 | Wuppertaler SV | - | Sachsen Leipzig | 4:0 | |
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| 30. Journée | 19.05.2004 | Borussia Dortmund II | - | Wuppertaler SV | 1:2 | ||||
| 32. Journée | 22.05.2004 | 1. FC Köln II | - | Wuppertaler SV | 4:0 | ||||
| 33. Journée | 30.05.2004 | Wuppertaler SV | - | Werder Bremen II | 1:0 | ||||
| 34. Journée | 05.06.2004 | VfR Neumünster | - | Wuppertaler SV | 2:1 |
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