| 1. Journée | 12.03.2000 | FC Thun | - | FC Baden | 4:0 | ||||
| 3. Journée | 26.03.2000 | FC Thun | - | FC Zürich | 0:1 | ||||
| 4. Journée | 02.04.2000 | FC Sion | - | FC Thun | 3:0 |  |
|||
| 6. Journée | 16.04.2000 | FC Aarau | - | FC Thun | 2:0 | |
|||
| 7. Journée | 22.04.2000 | FC Thun | - | AC Bellinzona | 1:1 | ||||
| 8. Journée | 30.04.2000 | AC Bellinzona | - | FC Thun | 0:2 |  |
|||
| 9. Journée | 06.05.2000 | FC Thun | - | FC Aarau | 1:0 | ||||
| 10. Journée | 13.05.2000 | SR Delémont | - | FC Thun | 2:3 | ||||
| 11. Journée | 20.05.2000 | FC Thun | - | FC Sion | 0:0 | ||||
| 12. Journée | 23.05.2000 | FC Zürich | - | FC Thun | 2:1 | ||||
| 13. Journée | 04.06.2000 | FC Thun | - | FC Lugano | 2:3 | ||||
| 14. Journée | 07.06.2000 | FC Baden | - | FC Thun | 1:1 |
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