| 24. Journée | 18.02.2006 | Holstein Kiel | - | Preußen Münster | 0:1 | ||||
| 25. Journée | 25.02.2006 | Preußen Münster | - | VfL Osnabrück | 2:1 | ||||
| 26. Journée | 04.03.2006 | SG Wattenscheid 09 | - | Preußen Münster | 0:2 | ||||
| 27. Journée | 10.03.2006 | Preußen Münster | - | Rot-Weiss Essen | 1:3 |  |
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| 28. Journée | 18.03.2006 | 1. FC Köln II | - | Preußen Münster | 0:2 | ||||
| 23. Journée | 21.03.2006 | Preußen Münster | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:1 |  |
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| 30. Journée | 02.04.2006 | Hamburger SV II | - | Preußen Münster | 0:2 | |
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| 22. Journée | 05.04.2006 | Chemnitzer FC | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 34. Journée | 29.04.2006 | VfB Lübeck | - | Preußen Münster | 2:1 |  |
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| 37. Journée | 20.05.2006 | Preußen Münster | - | Wuppertaler SV | 1:2 | ||||
| 38. Journée | 27.05.2006 | Bayer Leverkusen II | - | Preußen Münster | 1:3 | |
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