| 2e tour | 16.07.2013 | Birkirkara FC | - | NK Maribor | 0:0 | ||||
| 2e tour | 24.07.2013 | NK Maribor | - | Birkirkara FC | 2:0 |  |
|||
| 3e tour | 31.07.2013 | APOEL Nikosia | - | NK Maribor | 1:1 | ||||
| 3e tour | 06.08.2013 | NK Maribor | - | APOEL Nikosia | 0:0 | ||||
| Play-offs | 20.08.2013 | Viktoria Plzeň | - | NK Maribor | 3:1 |  |
|||
| Play-offs | 28.08.2013 | NK Maribor | - | Viktoria Plzeň | 0:1 |
Slovénie