| 3. Journée | 15.09.2012 | AC Milan | - | Atalanta | 0:1 | ||||
| 4. Journée | 23.09.2012 | Atalanta | - | US Palermo | 1:0 | ||||
| 5. Journée | 26.09.2012 | Calcio Catania | - | Atalanta | 2:1 | ||||
| 6. Journée | 30.09.2012 | Atalanta | - | Torino FC | 1:5 | ||||
| 7. Journée | 07.10.2012 | AS Roma | - | Atalanta | 2:0 | ||||
| 8. Journée | 21.10.2012 | Atalanta | - | AC Siena | 2:1 | ||||
| 10. Journée | 31.10.2012 | Atalanta | - | SSC Napoli | 1:0 | ||||
| 11. Journée | 04.11.2012 | Sampdoria | - | Atalanta | 1:2 |  |
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| 14. Journée | 25.11.2012 | Atalanta | - | Genoa CFC | 0:1 | ||||
| 15. Journée | 02.12.2012 | Bologna FC | - | Atalanta | 2:1 | ||||
| 16. Journée | 08.12.2012 | Atalanta | - | Parma FC | 2:1 | |
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| 18. Journée | 22.12.2012 | Atalanta | - | Udinese Calcio | 1:1 | ||||
| 19. Journée | 06.01.2013 | Chievo Verona | - | Atalanta | 1:0 | ||||
| 20. Journée | 13.01.2013 | Lazio Roma | - | Atalanta | 2:0 | |
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| 28. Journée | 10.03.2013 | Atalanta | - | Delfino Pescara | 2:1 | |
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| 35. Journée | 05.05.2013 | Parma FC | - | Atalanta | 2:0 | ||||
| 37. Journée | 12.05.2013 | Udinese Calcio | - | Atalanta | 2:1 | |
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| 38. Journée | 19.05.2013 | Atalanta | - | Chievo Verona | 2:2 | |
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