| 20. Journée | 28.02.2009 | VfB Lübeck | - | Hamburger SV II | 1:0 | ||||
| 21. Journée | 07.03.2009 | Hamburger SV II | - | SV Wilhelmshaven | 2:0 | ||||
| 22. Journée | 15.03.2009 | 1. FC Magdeburg | - | Hamburger SV II | 2:1 |  |
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| 23. Journée | 21.03.2009 | Hamburger SV II | - | Energie Cottbus II | 0:1 | ||||
| 24. Journée | 28.03.2009 | Altona 93 | - | Hamburger SV II | 1:3 | ||||
| 19. Journée | 10.04.2009 | Hamburger SV II | - | Sachsen Leipzig | 4:0 | ||||
| 26. Journée | 19.04.2009 | FC Oberneuland | - | Hamburger SV II | 0:3 | ||||
| 27. Journée | 26.04.2009 | Hamburger SV II | - | Chemnitzer FC | 2:2 | ||||
| 28. Journée | 02.05.2009 | Hannover 96 II | - | Hamburger SV II | 1:1 | ||||
| 29. Journée | 10.05.2009 | Hamburger SV II | - | Holstein Kiel | 0:2 | ||||
| 30. Journée | 13.05.2009 | SV Babelsberg 03 | - | Hamburger SV II | 6:1 | ||||
| 31. Journée | 17.05.2009 | Hamburger SV II | - | Hallescher FC | 1:1 | ||||
| 32. Journée | 24.05.2009 | Hamburger SV II | - | Hansa Rostock II | 3:0 | ||||
| 33. Journée | 30.05.2009 | Hertha BSC II | - | Hamburger SV II | 0:2 |  |
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| 34. Journée | 07.06.2009 | Hamburger SV II | - | VfL Wolfsburg II | 2:1 |
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