| 31. Journée | 04.02.2006 | Chesterfield FC | - | Gillingham FC | 1:1 | ||||
| 32. Journée | 11.02.2006 | Gillingham FC | - | Tranmere Rovers | 1:1 | ||||
| 33. Journée | 14.02.2006 | Swindon Town | - | Gillingham FC | 1:0 | ||||
| 34. Journée | 18.02.2006 | Doncaster Rovers | - | Gillingham FC | 2:0 | ||||
| 38. Journée | 18.03.2006 | Bristol City | - | Gillingham FC | 6:0 | ||||
| 36. Journée | 21.03.2006 | Gillingham FC | - | Brentford FC | 3:2 | ||||
| 39. Journée | 25.03.2006 | Gillingham FC | - | Swansea City | 1:0 | ||||
| 40. Journée | 01.04.2006 | Milton Keynes Dons | - | Gillingham FC | 1:2 | ||||
| 41. Journée | 08.04.2006 | Gillingham FC | - | Huddersfield Town | 2:0 |  |
|||
| 42. Journée | 14.04.2006 | Southend United | - | Gillingham FC | 0:1 | ||||
| 43. Journée | 17.04.2006 | Gillingham FC | - | Bradford City | 2:1 | ||||
| 44. Journée | 22.04.2006 | Yeovil Town | - | Gillingham FC | 4:3 | ||||
| 45. Journée | 29.04.2006 | Gillingham FC | - | Walsall FC | 0:1 |
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