| 3. Journée | 10.09.2016 | Hibernians FC | - | Mosta FC | 3:1 | ||||
| 4. Journée | 17.09.2016 | Mosta FC | - | Gżira United | 2:1 | ||||
| 5. Journée | 22.09.2016 | Birkirkara FC | - | Mosta FC | 2:0 | ||||
| 6. Journée | 26.09.2016 | Mosta FC | - | St. Andrews FC | 1:0 | ||||
| 7. Journée | 30.09.2016 | Mosta FC | - | Hamrun Spartans | 2:5 | ||||
| 9. Journée | 22.10.2016 | Mosta FC | - | Floriana FC | 0:1 |  |
|||
| 10. Journée | 30.10.2016 | Sliema Wanderers | - | Mosta FC | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 05.11.2016 | Mosta FC | - | Pembroke Athleta FC | 0:3 | ||||
| 15. Journée | 10.12.2016 | Gżira United | - | Mosta FC | 3:0 | ||||
| 16. Journée | 04.01.2017 | Mosta FC | - | Birkirkara FC | 0:2 | ||||
| 17. Journée | 07.01.2017 | St. Andrews FC | - | Mosta FC | 1:1 | ||||
| 18. Journée | 14.01.2017 | Mosta FC | - | Tarxien Rainbows | 0:2 |
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