| 2. Journée | 26.08.2006 | Panathinaikos | - | Ionikos Nikea | 0:2 | ||||
| 3. Journée | 10.09.2006 | Ionikos Nikea | - | Apollon Kalamarias | 1:0 |  |
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| 4. Journée | 16.09.2006 | Aris Saloniki | - | Ionikos Nikea | 1:0 | ||||
| 5. Journée | 24.09.2006 | Ionikos Nikea | - | AE Lárissa | 1:2 | ||||
| 6. Journée | 01.10.2006 | AO Kerkyra | - | Ionikos Nikea | 2:0 | ||||
| 7. Journée | 21.10.2006 | Ionikos Nikea | - | AO Egaleo | 0:1 | ||||
| 8. Journée | 29.10.2006 | Ionikos Nikea | - | Atromitos | 1:4 |  |
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| 9. Journée | 05.11.2006 | Skoda Xanthi | - | Ionikos Nikea | 2:0 | ||||
| 10. Journée | 12.11.2006 | Ionikos Nikea | - | Panionios GSS | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 19.11.2006 | PAOK Saloniki | - | Ionikos Nikea | 3:0 | |
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| 12. Journée | 26.11.2006 | Ionikos Nikea | - | OFI Heraklion | 0:2 | ||||
| 13. Journée | 02.12.2006 | AEK Athen | - | Ionikos Nikea | 2:0 | ||||
| 14. Journée | 09.12.2006 | Ionikos Nikea | - | Iraklis Saloniki | 0:3 | |
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| 15. Journée | 16.12.2006 | Olympiakos Piraeus | - | Ionikos Nikea | 3:0 | ||||
| 16. Journée | 07.01.2007 | Ionikos Nikea | - | Ergotelis | 1:3 | ||||
| 17. Journée | 14.01.2007 | Ionikos Nikea | - | Panathinaikos | 0:4 | |
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| 18. Journée | 21.01.2007 | Apollon Kalamarias | - | Ionikos Nikea | 1:0 |
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