| 18. Journée | 21.01.2007 | 1. FC Köln | - | FC Augsburg | 1:1 | ||||
| 19. Journée | 30.01.2007 | FC Augsburg | - | SC Paderborn 07 | 0:1 | ||||
| 20. Journée | 04.02.2007 | Rot-Weiss Essen | - | FC Augsburg | 0:0 | ||||
| 21. Journée | 09.02.2007 | FC Augsburg | - | SpVgg Unterhaching | 2:1 | ||||
| 24. Journée | 02.03.2007 | SpVgg Greuther Fürth | - | FC Augsburg | 2:1 |  |
|||
| 25. Journée | 09.03.2007 | FC Augsburg | - | TuS Koblenz | 2:0 | ||||
| 26. Journée | 16.03.2007 | TSV 1860 München | - | FC Augsburg | 0:3 | ||||
| 27. Journée | 01.04.2007 | FC Augsburg | - | Erzgebirge Aue | 3:0 | |
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| 28. Journée | 08.04.2007 | SC Freiburg | - | FC Augsburg | 2:0 | ||||
| 29. Journée | 13.04.2007 | FC Augsburg | - | MSV Duisburg | 1:2 | ||||
| 30. Journée | 22.04.2007 | Wacker Burghausen | - | FC Augsburg | 0:2 | ||||
| 31. Journée | 29.04.2007 | FC Augsburg | - | 1. FC Kaiserslautern | 3:2 | ||||
| 32. Journée | 04.05.2007 | FC Augsburg | - | Kickers Offenbach | 1:1 | ||||
| 33. Journée | 13.05.2007 | Eintracht Braunschweig | - | FC Augsburg | 0:1 | ||||
| 34. Journée | 20.05.2007 | FC Augsburg | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:2 |  |
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