| 19. Journée | 11.01.2009 | Girona FC | - | SD Eibar | 2:0 |  |
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| 20. Journée | 18.01.2009 | CD Tenerife | - | Girona FC | 4:1 | ||||
| 21. Journée | 24.01.2009 | Girona FC | - | SD Huesca | 2:0 | |
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| 23. Journée | 08.02.2009 | Alicante CF | - | Girona FC | 1:1 | ||||
| 24. Journée | 14.02.2009 | Girona FC | - | Albacete | 3:3 | |
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| 25. Journée | 22.02.2009 | UD Salamanca | - | Girona FC | 2:2 | ||||
| 26. Journée | 28.02.2009 | Girona FC | - | Córdoba CF | 1:1 |  |
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| 27. Journée | 07.03.2009 | Rayo Vallecano | - | Girona FC | 1:1 | ||||
| 28. Journée | 15.03.2009 | Girona FC | - | Levante UD | 0:0 | ||||
| 29. Journée | 22.03.2009 | Real Sociedad | - | Girona FC | 2:0 | ||||
| 30. Journée | 28.03.2009 | Girona FC | - | UD Las Palmas | 2:2 | |
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| 31. Journée | 04.04.2009 | Real Zaragoza | - | Girona FC | 1:0 | ||||
| 32. Journée | 11.04.2009 | Girona FC | - | Real Murcia | 1:0 | |
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| 39. Journée | 30.05.2009 | Girona FC | - | Gimnàstic de Tarragona | 2:1 | ||||
| 40. Journée | 07.06.2009 | SD Eibar | - | Girona FC | 2:2 | |
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| 41. Journée | 13.06.2009 | Girona FC | - | CD Tenerife | 0:1 | ||||
| 42. Journée | 20.06.2009 | SD Huesca | - | Girona FC | 3:1 |
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