| 2. Journée | 11.04.1999 | Shinnik Yaroslavl | - | Zenit St. Petersburg | 0:0 | ||||
| 3. Journée | 17.04.1999 | Spartak Moskva | - | Shinnik Yaroslavl | 4:1 |  |
|||
| 4. Journée | 25.04.1999 | Shinnik Yaroslavl | - | CSKA Moskva | 0:0 | ||||
| 5. Journée | 02.05.1999 | Rotor Volgograd (1929-2005) | - | Shinnik Yaroslavl | 2:0 | ||||
| 6. Journée | 09.05.1999 | Shinnik Yaroslavl | - | Rostselmash Rostov | 0:3 | ||||
| 9. Journée | 29.05.1999 | FK Saturn | - | Shinnik Yaroslavl | 0:0 | ||||
| 11. Journée | 19.06.1999 | Lokomotiv Moskva | - | Shinnik Yaroslavl | 4:1 | ||||
| 17. Journée | 21.07.1999 | Shinnik Yaroslavl | - | Spartak Moskva | 1:2 | ||||
| 19. Journée | 04.08.1999 | Shinnik Yaroslavl | - | Rotor Volgograd (1929-2005) | 2:0 | ||||
| 22. Journée | 28.08.1999 | Lok. Nizhni Novgorod | - | Shinnik Yaroslavl | 1:0 | ||||
| 23. Journée | 11.09.1999 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Saturn | 0:0 | ||||
| 24. Journée | 18.09.1999 | Zhemchuzhina Sochi | - | Shinnik Yaroslavl | 1:0 | ||||
| 28. Journée | 23.10.1999 | Alania Vladikavkaz | - | Shinnik Yaroslavl | 3:1 | ||||
| 29. Journée | 30.10.1999 | Shinnik Yaroslavl | - | Uralan Elista | 1:0 | |
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| 30. Journée | 08.11.1999 | Chernomorets Novorossisk | - | Shinnik Yaroslavl | 1:1 |  |
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