| 3. Journée | 30.08.2008 | Hannover 96 II | - | Altona 93 | 0:2 | ||||
| 4. Journée | 14.09.2008 | Türkiyemspor Berlin | - | Hannover 96 II | 1:2 | ||||
| 5. Journée | 20.09.2008 | Hannover 96 II | - | FC Oberneuland | 1:2 | ||||
| 6. Journée | 27.09.2008 | Chemnitzer FC | - | Hannover 96 II | 1:1 |  |
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| 7. Journée | 04.10.2008 | Hansa Rostock II | - | Hannover 96 II | 1:4 | ||||
| 8. Journée | 19.10.2008 | Hannover 96 II | - | Holstein Kiel | 1:3 | ||||
| 9. Journée | 24.10.2008 | SV Babelsberg 03 | - | Hannover 96 II | 1:1 | ||||
| 10. Journée | 29.10.2008 | Hannover 96 II | - | Hallescher FC | 0:1 | ||||
| 11. Journée | 01.11.2008 | Hamburger SV II | - | Hannover 96 II | 0:3 |  |
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| 12. Journée | 08.11.2008 | Hannover 96 II | - | Hertha BSC II | 4:2 | |
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| 13. Journée | 16.11.2008 | VfL Wolfsburg II | - | Hannover 96 II | 1:0 | ||||
| 15. Journée | 29.11.2008 | Sachsen Leipzig | - | Hannover 96 II | 0:1 | |
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| 16. Journée | 06.12.2008 | Hannover 96 II | - | VfB Lübeck | 0:0 | ||||
| 17. Journée | 13.12.2008 | SV Wilhelmshaven | - | Hannover 96 II | 2:0 | ||||
| 24. Journée | 28.03.2009 | Hannover 96 II | - | Hansa Rostock II | 1:1 | ||||
| 25. Journée | 05.04.2009 | Holstein Kiel | - | Hannover 96 II | 2:0 |
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