| Serie A | 07.02.16 | Independiente del Valle | - | Deportivo Cuenca | 2:1 | ||||
| Serie A | 02.04.16 | Deportivo Cuenca | - | Barcelona | 1:2 | ||||
| Serie A | 13.08.16 | Mushuc Runa | - | Deportivo Cuenca | 3:2 |  |
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| Serie A | 17.09.16 | Deportivo Cuenca | - | Universidad Catolica | 0:1 | ||||
| Serie A | 23.10.16 | Universidad Catolica | - | Deportivo Cuenca | 3:2 |  |
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