| 1er tour | 07.09.1988 | Dnepr Dnepropetrovsk | - | Girondins Bordeaux | 1:1 | ||||
| 1er tour | 05.10.1988 | Girondins Bordeaux | - | Dnepr Dnepropetrovsk | 2:1 |  |
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| 2e tour | 26.10.1988 | Újpesti Dózsa SC | - | Girondins Bordeaux | 0:1 | ||||
| 2e tour | 09.11.1988 | Girondins Bordeaux | - | Újpesti Dózsa SC | 1:0 | ||||
| tour des 16 | 23.11.1988 | Girondins Bordeaux | - | SSC Napoli | 0:1 | ||||
| tour des 16 | 07.12.1988 | SSC Napoli | - | Girondins Bordeaux | 0:0 |
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