| 1. Journée | 06.03.2016 | FK Jonava | - | FK Sūduva | 1:1 | ||||
| 2. Journée | 13.03.2016 | Utenis Utena | - | FK Jonava | 0:1 | ||||
| 3. Journée | 17.03.2016 | FK Jonava | - | Kauno Žalgiris | 2:2 | ||||
| 4. Journée | 20.03.2016 | FK Jonava | - | FK Atlantas | 0:1 | ||||
| 6. Journée | 10.04.2016 | FK Jonava | - | FK Trakai | 0:1 | ||||
| 8. Journée | 20.04.2016 | FK Sūduva | - | FK Jonava | 3:0 | ||||
| 9. Journée | 26.04.2016 | FK Jonava | - | Utenis Utena | 1:0 | ||||
| 10. Journée | 04.05.2016 | Kauno Žalgiris | - | FK Jonava | 1:5 | ||||
| 11. Journée | 08.05.2016 | FK Atlantas | - | FK Jonava | 2:0 | ||||
| 14. Journée | 08.06.2016 | FK Jonava | - | FC Stumbras | 2:2 | ||||
| 15. Journée | 16.06.2016 | FK Jonava | - | FK Sūduva | 1:1 |  |
|||
| 22. Journée | 17.08.2016 | FK Sūduva | - | FK Jonava | 0:0 | ||||
| 23. Journée | 25.08.2016 | FK Jonava | - | Utenis Utena | 1:0 | ||||
| 24. Journée | 08.09.2016 | Kauno Žalgiris | - | FK Jonava | 0:1 | ||||
| 25. Journée | 15.09.2016 | FK Atlantas | - | FK Jonava | 0:0 | ||||
| 26. Journée | 20.09.2016 | FK Jonava | - | FK Žalgiris | 0:4 | |
|||
| 27. Journée | 02.10.2016 | FK Trakai | - | FK Jonava | 0:2 | ||||
| 28. Journée | 16.10.2016 | FK Jonava | - | FC Stumbras | 1:4 |
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