| 2. Journée | 13.08.2016 | Colchester United | - | Cambridge United | 2:0 | ||||
| 3. Journée | 16.08.2016 | Colchester United | - | Grimsby Town | 3:2 | ||||
| 4. Journée | 20.08.2016 | Portsmouth FC | - | Colchester United | 2:0 | ||||
| 42. Journée | 14.04.2017 | Colchester United | - | Doncaster Rovers | 1:1 | ||||
| 43. Journée | 17.04.2017 | Morecambe FC | - | Colchester United | 1:1 |  |
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| 44. Journée | 22.04.2017 | Colchester United | - | Plymouth Argyle | 0:0 | ||||
| 45. Journée | 29.04.2017 | Leyton Orient | - | Colchester United | 1:3 | |
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| 46. Journée | 06.05.2017 | Colchester United | - | Yeovil Town | 2:0 |
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