| 1. Journée | 11.07.2016 | FK Tosno | - | FK Khimki | 1:1 | ||||
| 2. Journée | 16.07.2016 | FK Khimki | - | FK Tambov | 0:0 | ||||
| 3. Journée | 23.07.2016 | SKA-Khabarovsk | - | FK Khimki | 1:1 | ||||
| 4. Journée | 27.07.2016 | FK Neftekhimik | - | FK Khimki | 1:0 | ||||
| 7. Journée | 13.08.2016 | FK Khimki | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 4:1 | ||||
| 8. Journée | 17.08.2016 | Fakel Voronezh | - | FK Khimki | 2:0 | ||||
| 9. Journée | 21.08.2016 | FK Khimki | - | Sokol Saratov | 0:0 | ||||
| 10. Journée | 28.08.2016 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Khimki | 2:0 | ||||
| 24. Journée | 26.11.2016 | FK Khimki | - | Mordovia Saransk | 4:3 | ||||
| 27. Journée | 17.05.2017 | Sokol Saratov | - | FK Khimki | 1:0 | ||||
| 38. Journée | 20.05.2017 | FK Khimki | - | FK Tosno | 1:3 |
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