| 6. Journée | 18.10.2008 | Panionios GSS | - | Aris Saloniki | 2:1 | ||||
| 7. Journée | 26.10.2008 | Aris Saloniki | - | Olympiakos Piraeus | 1:0 | ||||
| 8. Journée | 01.11.2008 | Aris Saloniki | - | AE Lárissa | 0:0 | ||||
| 10. Journée | 15.11.2008 | Aris Saloniki | - | Asteras Tripolis | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 23.11.2008 | Skoda Xanthi | - | Aris Saloniki | 1:1 |  |
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| 12. Journée | 30.11.2008 | Aris Saloniki | - | Panserraikos | 2:0 | |
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| 13. Journée | 06.12.2008 | OFI Heraklion | - | Aris Saloniki | 0:1 | ||||
| 14. Journée | 14.12.2008 | Aris Saloniki | - | AEK Athen | 1:1 | ||||
| 15. Journée | 21.12.2008 | Panthrakikos | - | Aris Saloniki | 0:0 | ||||
| 16. Journée | 04.01.2009 | Levadiakos | - | Aris Saloniki | 2:0 | ||||
| 17. Journée | 11.01.2009 | Aris Saloniki | - | Ergotelis | 0:0 | ||||
| 26. Journée | 14.03.2009 | Aris Saloniki | - | Skoda Xanthi | 0:1 | |
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| 27. Journée | 22.03.2009 | Panserraikos | - | Aris Saloniki | 1:2 |
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