| 3. Journée | 11.09.2016 | PAS Giannina | - | Atromitos | 3:0 | ||||
| 4. Journée | 18.09.2016 | Atromitos | - | Panetolikos | 0:2 | ||||
| 5. Journée | 25.09.2016 | Atromitos | - | Asteras Tripolis | 1:0 | ||||
| 6. Journée | 03.10.2016 | Xanthi FC | - | Atromitos | 0:0 | ||||
| 7. Journée | 16.10.2016 | Atromitos | - | Veria FC | 1:0 | ||||
| 8. Journée | 23.10.2016 | AEP Iraklis FC | - | Atromitos | 1:2 |  |
|||
| 9. Journée | 29.10.2016 | Atromitos | - | Olympiakos Piraeus | 0:1 | ||||
| 12. Journée | 28.11.2016 | PAOK Saloniki | - | Atromitos | 3:4 |  |
|||
| 14. Journée | 11.12.2016 | Atromitos | - | Panathinaikos | 0:1 | ||||
| 15. Journée | 17.12.2016 | Platanias Chanion | - | Atromitos | 3:0 | |
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