| 1er tour | 06.08.2003 | Deportivo Pasto | - | Atlético Nacional | 0:0 | ||||
| tour des 16 | 18.09.2003 | LDU Quito | - | Atlético Nacional | 1:1 | ||||
| tour des 16 | 02.10.2003 | Atlético Nacional | - | LDU Quito | 1:0 | ||||
| Quarts de finale | 22.10.2003 | Boca Juniors | - | Atlético Nacional | 0:1 | ||||
| Quarts de finale | 05.11.2003 | Atlético Nacional | - | Boca Juniors | 4:1 |  |
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| Demi-finales | 13.11.2003 | Atlético Nacional | - | Cienciano | 1:2 | ||||
| Demi-finales | 04.12.2003 | Cienciano | - | Atlético Nacional | 1:0 |
Colombie