| 1. Journée | 18.08.2008 | MSV Duisburg | - | Hansa Rostock | 2:2 |  |
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| 5. Journée | 19.09.2008 | Rot Weiss Ahlen | - | Hansa Rostock | 2:2 | ||||
| 6. Journée | 26.09.2008 | Hansa Rostock | - | FC St. Pauli | 3:0 | ||||
| 7. Journée | 05.10.2008 | FC Ingolstadt 04 | - | Hansa Rostock | 4:2 | ||||
| 8. Journée | 19.10.2008 | Hansa Rostock | - | TuS Koblenz | 9:0 | ||||
| 9. Journée | 24.10.2008 | FSV Frankfurt | - | Hansa Rostock | 0:0 | ||||
| 10. Journée | 28.10.2008 | Hansa Rostock | - | SpVgg Greuther Fürth | 1:2 | |
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| 13. Journée | 17.11.2008 | 1. FC Kaiserslautern | - | Hansa Rostock | 6:0 | ||||
| 28. Journée | 17.04.2009 | Hansa Rostock | - | Rot-Weiß Oberhausen | 3:1 |
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