| 1. Journée | 13.08.2006 | Eintracht Braunschweig | - | SC Paderborn 07 | 0:0 | ||||
| 2. Journée | 18.08.2006 | FC Carl Zeiss Jena | - | Eintracht Braunschweig | 0:0 | ||||
| 3. Journée | 27.08.2006 | Eintracht Braunschweig | - | TuS Koblenz | 0:2 | ||||
| 8. Journée | 22.10.2006 | Erzgebirge Aue | - | Eintracht Braunschweig | 3:0 | ||||
| 10. Journée | 03.11.2006 | SC Freiburg | - | Eintracht Braunschweig | 1:0 |  |
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| 11. Journée | 07.11.2006 | Eintracht Braunschweig | - | SpVgg Unterhaching | 2:3 | ||||
| 12. Journée | 10.11.2006 | Hansa Rostock | - | Eintracht Braunschweig | 4:0 | ||||
| 13. Journée | 17.11.2006 | Eintracht Braunschweig | - | MSV Duisburg | 1:1 | ||||
| 14. Journée | 26.11.2006 | Wacker Burghausen | - | Eintracht Braunschweig | 1:1 | ||||
| 15. Journée | 03.12.2006 | Eintracht Braunschweig | - | 1. FC Kaiserslautern | 0:1 |
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