| 1. Journée | 30.07.2005 | Rot-Weiß Erfurt | - | 1. FC Köln II | 4:3 | ||||
| 2. Journée | 03.08.2005 | 1. FC Köln II | - | Kickers Emden | 0:3 | ||||
| 3. Journée | 06.08.2005 | VfB Lübeck | - | 1. FC Köln II | 4:1 | ||||
| 5. Journée | 23.08.2005 | Rot-Weiß Oberhausen | - | 1. FC Köln II | 2:2 | ||||
| 18. Journée | 19.11.2005 | Hamburger SV II | - | 1. FC Köln II | 0:1 | ||||
| 28. Journée | 18.03.2006 | 1. FC Köln II | - | Preußen Münster | 0:2 | ||||
| 29. Journée | 25.03.2006 | Chemnitzer FC | - | 1. FC Köln II | 0:3 | ||||
| 26. Journée | 29.03.2006 | 1. FC Köln II | - | Bayer Leverkusen II | 5:0 |  |
|||
| 30. Journée | 01.04.2006 | 1. FC Köln II | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:1 | ||||
| 31. Journée | 08.04.2006 | Holstein Kiel | - | 1. FC Köln II | 5:1 | ||||
| 32. Journée | 15.04.2006 | 1. FC Köln II | - | VfL Osnabrück | 0:0 |  |
|||
| 33. Journée | 22.04.2006 | SG Wattenscheid 09 | - | 1. FC Köln II | 4:2 | ||||
| 38. Journée | 27.05.2006 | Werder Bremen II | - | 1. FC Köln II | 2:2 |
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