| 4. Journée | 16.08.2020 | FK Tom Tomsk | - | Irtysh Omsk | 1:1 | ||||
| 5. Journée | 22.08.2020 | FK Tom Tomsk | - | Dinamo Bryansk | 0:2 | ||||
| 9. Journée | 13.09.2020 | Krylia Sovetov | - | FK Tom Tomsk | 2:0 | ||||
| 10. Journée | 19.09.2020 | FK Tom Tomsk | - | Volgar Astrakhan | 1:3 | ||||
| 16. Journée | 17.10.2020 | FK Tom Tomsk | - | Baltika Kaliningrad | 0:1 | ||||
| 17. Journée | 24.10.2020 | Veles Moskva | - | FK Tom Tomsk | 0:0 | ||||
| 18. Journée | 28.10.2020 | FK Tom Tomsk | - | SKA-Khabarovsk | 1:2 | ||||
| 19. Journée | 01.11.2020 | FK Chayka | - | FK Tom Tomsk | 1:1 | ||||
| 20. Journée | 07.11.2020 | FK Tom Tomsk | - | FK Orenburg | 0:1 | ||||
| 21. Journée | 11.11.2020 | Enisey Krasnoyarsk | - | FK Tom Tomsk | 0:1 | ||||
| 22. Journée | 15.11.2020 | FK Tom Tomsk | - | FK Chertanovo | 1:2 |  |
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