| 1. Journée | 17.08.2008 | Rot Weiss Ahlen | - | FSV Frankfurt | 2:1 | ||||
| 2. Journée | 22.08.2008 | FSV Frankfurt | - | TuS Koblenz | 0:0 |  |
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| 3. Journée | 31.08.2008 | FSV Frankfurt | - | SpVgg Greuther Fürth | 1:1 | ||||
| 5. Journée | 21.09.2008 | FSV Frankfurt | - | Rot-Weiß Oberhausen | 3:1 | ||||
| 6. Journée | 28.09.2008 | 1. FC Kaiserslautern | - | FSV Frankfurt | 2:1 | ||||
| 7. Journée | 03.10.2008 | FSV Frankfurt | - | TSV 1860 München | 0:3 | ||||
| 8. Journée | 19.10.2008 | SV Wehen Wiesbaden | - | FSV Frankfurt | 3:1 | ||||
| 12. Journée | 07.11.2008 | 1. FC Nürnberg | - | FSV Frankfurt | 0:0 | ||||
| 15. Journée | 01.12.2008 | FSV Frankfurt | - | 1. FSV Mainz 05 | 1:4 | |
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| 16. Journée | 05.12.2008 | FC Ingolstadt 04 | - | FSV Frankfurt | 1:1 | ||||
| 17. Journée | 12.12.2008 | FSV Frankfurt | - | FC St. Pauli | 1:0 | |
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| 18. Journée | 01.02.2009 | FSV Frankfurt | - | Rot Weiss Ahlen | 4:0 |  |
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| 19. Journée | 06.02.2009 | TuS Koblenz | - | FSV Frankfurt | 1:3 | ||||
| 20. Journée | 13.02.2009 | SpVgg Greuther Fürth | - | FSV Frankfurt | 0:0 | ||||
| 21. Journée | 22.02.2009 | FSV Frankfurt | - | VfL Osnabrück | 1:0 | ||||
| 34. Journée | 24.05.2009 | FC St. Pauli | - | FSV Frankfurt | 2:0 |
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