| 1. Journée | 06.08.2005 | Bayern München II | - | Jahn Regensburg | 1:0 |  |
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| 2. Journée | 13.08.2005 | Jahn Regensburg | - | Stuttgarter Kickers | 2:2 | |
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| 3. Journée | 24.08.2005 | TSG Hoffenheim | - | Jahn Regensburg | 1:1 | ||||
| 4. Journée | 27.08.2005 | Jahn Regensburg | - | SV 07 Elversberg | 1:2 | ||||
| 5. Journée | 03.09.2005 | TuS Koblenz | - | Jahn Regensburg | 3:3 | ||||
| 6. Journée | 10.09.2005 | Jahn Regensburg | - | FC Augsburg | 0:4 | |
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| 7. Journée | 17.09.2005 | SpVgg Bayreuth | - | Jahn Regensburg | 2:1 | ||||
| 8. Journée | 21.09.2005 | Jahn Regensburg | - | 1. FC Eschborn | 2:2 | ||||
| 10. Journée | 01.10.2005 | Jahn Regensburg | - | VfB Stuttgart II | 3:3 | ||||
| 11. Journée | 15.10.2005 | Karlsruher SC II | - | Jahn Regensburg | 2:0 | |
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| 18. Journée | 15.11.2005 | Jahn Regensburg | - | Bayern München II | 1:0 | ||||
| 16. Journée | 18.11.2005 | VfR Aalen | - | Jahn Regensburg | 1:0 | ||||
| 17. Journée | 26.11.2005 | Jahn Regensburg | - | SC Pfullendorf | 1:0 | ||||
| 21. Journée | 25.02.2006 | SV 07 Elversberg | - | Jahn Regensburg | 1:1 | ||||
| 25. Journée | 25.03.2006 | 1. FC Eschborn | - | Jahn Regensburg | 0:0 | ||||
| 26. Journée | 01.04.2006 | Jahn Regensburg | - | TSV 1860 München II | 1:3 |
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