| Groupe A | 22.08.2016 | Defensor La Bocana | - | Deportivo Municipal | 1:2 | ||||
| Groupe A | 25.08.2016 | Deportivo Municipal | - | Juan Aurich | 1:4 | ||||
| Groupe A | 11.09.2016 | FBC Melgar | - | Deportivo Municipal | 2:1 | ||||
| Groupe A | 17.09.2016 | Deportivo Municipal | - | Universidad Cesar Vallejo | 2:1 | ||||
| Groupe A | 25.09.2016 | Unión Comercio | - | Deportivo Municipal | 1:2 | ||||
| Groupe A | 27.09.2016 | Sporting Cristal | - | Deportivo Municipal | 0:2 | ||||
| Groupe A | 15.10.2016 | Deportivo Municipal | - | Real Garcilaso | 1:0 | ||||
| Groupe A | 20.10.2016 | Deportivo Municipal | - | Defensor La Bocana | 2:2 |  |
|||
| Groupe A | 29.10.2016 | Deportivo Municipal | - | FBC Melgar | 0:0 | ||||
| Groupe A | 04.11.2016 | Universidad Cesar Vallejo | - | Deportivo Municipal | 3:0 | ||||
| Groupe A | 19.11.2016 | Deportivo Municipal | - | Unión Comercio | 2:0 |  |
Pérou