| 2. Journée | 27.08.2006 | AE Lárissa | - | Atromitos | 2:1 | ||||
| 4. Journée | 17.09.2006 | AO Kerkyra | - | Atromitos | 1:0 | ||||
| 5. Journée | 24.09.2006 | Atromitos | - | Iraklis Saloniki | 2:2 | ||||
| 6. Journée | 01.10.2006 | AO Egaleo | - | Atromitos | 0:0 | ||||
| 7. Journée | 22.10.2006 | Atromitos | - | Olympiakos Piraeus | 1:0 |  |
|||
| 8. Journée | 29.10.2006 | Ionikos Nikea | - | Atromitos | 1:4 | ||||
| 9. Journée | 05.11.2006 | Atromitos | - | Ergotelis | 2:1 | ||||
| 10. Journée | 12.11.2006 | Skoda Xanthi | - | Atromitos | 1:0 | |
|||
| 11. Journée | 19.11.2006 | Atromitos | - | Panathinaikos | 0:4 |
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