| 1er tour | 28.09.2006 | CA Osasuna | - | Trabzonspor | 0:0 |  |
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| Groupe D | 19.10.2006 | CA Osasuna | - | sc Heerenveen | 0:0 | ||||
| Groupe D | 02.11.2006 | RC Lens | - | CA Osasuna | 3:1 | |
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| Groupe D | 29.11.2006 | CA Osasuna | - | Odense BK | 3:1 | |
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| 3e tour | 14.02.2007 | Girondins Bordeaux | - | CA Osasuna | 0:0 | ||||
| 3e tour | 22.02.2007 | CA Osasuna | - | Girondins Bordeaux | 1:0 ap | ||||
| tour des 16 | 14.03.2007 | CA Osasuna | - | Rangers FC | 1:0 | |
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| Quarts de finale | 05.04.2007 | Bayer Leverkusen | - | CA Osasuna | 0:3 | |
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| Demi-finales | 26.04.2007 | CA Osasuna | - | Sevilla FC | 1:0 | ||||
| Demi-finales | 03.05.2007 | Sevilla FC | - | CA Osasuna | 2:0 |
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