| 1. Journée | 21.08.2016 | UD SS Reyes | - | SD Gernika | 2:1 |  |
 |
||
| 3. Journée | 04.09.2016 | CD Mensajero | - | SD Gernika | 3:2 | ||||
| 4. Journée | 10.09.2016 | SD Gernika | - | Real Madrid Castilla | 0:0 | ||||
| 5. Journée | 17.09.2016 | Real Sociedad B | - | SD Gernika | 4:0 | |
|||
| 6. Journée | 25.09.2016 | SD Gernika | - | Real Unión | 2:2 | ||||
| 7. Journée | 01.10.2016 | SD Amorebieta | - | SD Gernika | 3:1 | ||||
| 10. Journée | 23.10.2016 | CF Fuenlabrada | - | SD Gernika | 4:2 | ||||
| 11. Journée | 29.10.2016 | SD Gernika | - | Rayo Majadahonda | 0:1 | |
|||
| 13. Journée | 06.11.2016 | SD Gernika | - | UD Socuéllamos | 3:2 | ||||
| 15. Journée | 19.11.2016 | SD Gernika | - | Athletic Club B | 1:0 | ||||
| 16. Journée | 27.11.2016 | Barakaldo CF | - | SD Gernika | 0:1 | ||||
| 22. Journée | 22.01.2017 | SD Gernika | - | CD Mensajero | 0:0 | ||||
| 25. Journée | 12.02.2017 | Real Unión | - | SD Gernika | 2:2 | ||||
| 27. Journée | 26.02.2017 | Albacete | - | SD Gernika | 3:2 | ||||
| 29. Journée | 11.03.2017 | SD Gernika | - | CF Fuenlabrada | 1:2 | ||||
| 30. Journée | 19.03.2017 | Rayo Majadahonda | - | SD Gernika | 2:0 | |
|||
| 35. Journée | 23.04.2017 | SD Gernika | - | Barakaldo CF | 2:0 | ||||
| 38. Journée | 14.05.2017 | UD Logroñés | - | SD Gernika | 5:1 |
Espagne