| 6. Journée | 26.09.2008 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | SV Wehen Wiesbaden II | 0:4 | ||||
| 16. Journée | 06.12.2008 | SV Darmstadt 98 | - | SV Wehen Wiesbaden II | 0:1 | ||||
| 18. Journée | 15.02.2009 | SpVgg Unterhaching II | - | SV Wehen Wiesbaden II | 0:2 | ||||
| 21. Journée | 07.03.2009 | SV Wehen Wiesbaden II | - | SC Pfullendorf | 1:1 | ||||
| 23. Journée | 21.03.2009 | SV Wehen Wiesbaden II | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 3:0 | ||||
| 24. Journée | 28.03.2009 | TSV 1860 München II | - | SV Wehen Wiesbaden II | 0:1 | ||||
| 27. Journée | 25.04.2009 | SV Wehen Wiesbaden II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 2:2 |  |
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| 28. Journée | 01.05.2009 | Waldhof Mannheim | - | SV Wehen Wiesbaden II | 1:0 | |
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| 31. Journée | 16.05.2009 | SV Wehen Wiesbaden II | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 0:1 | ||||
| 19. Journée | 26.05.2009 | SV Wehen Wiesbaden II | - | Karlsruher SC II | 1:0 | ||||
| 33. Journée | 04.06.2009 | SV Wehen Wiesbaden II | - | SV Darmstadt 98 | 2:0 | ||||
| 34. Journée | 06.06.2009 | Viktoria Aschaffenburg | - | SV Wehen Wiesbaden II | 2:0 |
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