| 5. Journée | 26.08.2006 | Werder Bremen II | - | Hamburger SV II | 3:1 | ||||
| 10. Journée | 30.09.2006 | Fortuna Düsseldorf | - | Werder Bremen II | 2:2 | ||||
| 11. Journée | 14.10.2006 | Werder Bremen II | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:1 | ||||
| 14. Journée | 04.11.2006 | Wuppertaler SV | - | Werder Bremen II | 2:0 | ||||
| 15. Journée | 08.11.2006 | Werder Bremen II | - | Borussia Dortmund II | 0:1 | ||||
| 16. Journée | 11.11.2006 | VfB Lübeck | - | Werder Bremen II | 0:2 | ||||
| 21. Journée | 28.02.2007 | Werder Bremen II | - | Bayer Leverkusen II | 1:0 | ||||
| 24. Journée | 03.03.2007 | Hamburger SV II | - | Werder Bremen II | 0:3 | ||||
| 25. Journée | 10.03.2007 | Werder Bremen II | - | Holstein Kiel | 2:3 | ||||
| 30. Journée | 07.04.2007 | Rot-Weiß Erfurt | - | Werder Bremen II | 1:1 | ||||
| 31. Journée | 14.04.2007 | Werder Bremen II | - | Dynamo Dresden | 1:1 | ||||
| 23. Journée | 24.04.2007 | Werder Bremen II | - | FC St. Pauli | 0:2 | ||||
| 35. Journée | 13.05.2007 | Werder Bremen II | - | VfB Lübeck | 2:0 |
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