| 1. Journée | 18.08.2012 | Gillingham FC | - | Bradford City | 3:1 | ||||
| 2. Journée | 21.08.2012 | Wycombe Wanderers | - | Gillingham FC | 0:1 | ||||
| 7. Journée | 18.09.2012 | Gillingham FC | - | Southend United | 1:0 |  |
|||
| 13. Journée | 20.10.2012 | Gillingham FC | - | Burton Albion | 4:1 | ||||
| 14. Journée | 23.10.2012 | Torquay United | - | Gillingham FC | 2:1 | ||||
| 21. Journée | 08.12.2012 | Rotherham United | - | Gillingham FC | 1:2 | ||||
| 33. Journée | 16.02.2013 | Gillingham FC | - | Dagenham & Redbridge | 2:1 | ||||
| 35. Journée | 26.02.2013 | Gillingham FC | - | Oxford United | 0:1 | ||||
| 36. Journée | 02.03.2013 | Aldershot Town | - | Gillingham FC | 1:1 | ||||
| 37. Journée | 09.03.2013 | Gillingham FC | - | Plymouth Argyle | 2:1 | ||||
| 38. Journée | 12.03.2013 | Exeter City | - | Gillingham FC | 0:0 | ||||
| 39. Journée | 16.03.2013 | Morecambe FC | - | Gillingham FC | 1:1 |  |
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| 29. Journée | 19.03.2013 | Rochdale AFC | - | Gillingham FC | 1:1 | ||||
| 43. Journée | 06.04.2013 | Gillingham FC | - | Torquay United | 1:0 | ||||
| 44. Journée | 13.04.2013 | Cheltenham Town | - | Gillingham FC | 1:0 | ||||
| 46. Journée | 27.04.2013 | Burton Albion | - | Gillingham FC | 3:2 |
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