| 2. Journée | 10.08.2003 | 1. FC Union Berlin | - | Energie Cottbus | 0:1 |  |
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| 9. Journée | 19.10.2003 | Energie Cottbus | - | Wacker Burghausen | 2:1 | ||||
| 10. Journée | 27.10.2003 | 1. FSV Mainz 05 | - | Energie Cottbus | 4:1 | ||||
| 11. Journée | 31.10.2003 | Arminia Bielefeld | - | Energie Cottbus | 1:3 | ||||
| 12. Journée | 10.11.2003 | Energie Cottbus | - | Erzgebirge Aue | 2:1 | ||||
| 15. Journée | 07.12.2003 | VfB Lübeck | - | Energie Cottbus | 1:1 | ||||
| 16. Journée | 14.12.2003 | Energie Cottbus | - | SpVgg Unterhaching | 3:1 | ||||
| 17. Journée | 18.12.2003 | Jahn Regensburg | - | Energie Cottbus | 0:0 | ||||
| 18. Journée | 01.02.2004 | Eintracht Trier | - | Energie Cottbus | 2:0 | ||||
| 21. Journée | 20.02.2004 | Energie Cottbus | - | 1. FC Nürnberg | 1:3 | ||||
| 23. Journée | 07.03.2004 | Energie Cottbus | - | Rot-Weiß Oberhausen | 3:1 | ||||
| 24. Journée | 12.03.2004 | LR Ahlen | - | Energie Cottbus | 0:0 | ||||
| 25. Journée | 19.03.2004 | Energie Cottbus | - | Karlsruher SC | 2:1 | ||||
| 27. Journée | 05.04.2004 | Energie Cottbus | - | 1. FSV Mainz 05 | 0:0 | ||||
| 29. Journée | 16.04.2004 | Erzgebirge Aue | - | Energie Cottbus | 1:0 | |
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| 32. Journée | 09.05.2004 | Energie Cottbus | - | VfB Lübeck | 1:1 |
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