| 1. Journée | 03.08.2003 | Eintracht Braunschweig | - | Dynamo Dresden | 3:2 | ||||
| 2. Journée | 09.08.2003 | Wuppertaler SV | - | Eintracht Braunschweig | 1:1 | ||||
| 3. Journée | 15.08.2003 | Eintracht Braunschweig | - | Hamburger SV II | 5:2 | ||||
| 5. Journée | 27.08.2003 | Eintracht Braunschweig | - | Rot-Weiss Essen | 1:0 | ||||
| 6. Journée | 07.09.2003 | Chemnitzer FC | - | Eintracht Braunschweig | 0:2 |  |
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| 7. Journée | 13.09.2003 | Eintracht Braunschweig | - | SC Paderborn 07 | 2:0 |  |
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| 8. Journée | 21.09.2003 | FC Schalke 04 II | - | Eintracht Braunschweig | 3:1 | |
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| 9. Journée | 26.09.2003 | Eintracht Braunschweig | - | Borussia Dortmund II | 0:1 | |
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| 10. Journée | 04.10.2003 | Sachsen Leipzig | - | Eintracht Braunschweig | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 10.10.2003 | Eintracht Braunschweig | - | 1. FC Köln II | 2:3 | ||||
| 13. Journée | 25.10.2003 | Eintracht Braunschweig | - | VfR Neumünster | 1:1 | ||||
| 14. Journée | 02.11.2003 | KFC Uerdingen 05 | - | Eintracht Braunschweig | 3:0 | ||||
| 17. Journée | 22.11.2003 | FC St. Pauli | - | Eintracht Braunschweig | 1:0 | ||||
| 18. Journée | 28.11.2003 | Dynamo Dresden | - | Eintracht Braunschweig | 1:0 | |
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